Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCNX1Q96RV3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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