Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms