Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms