Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms