Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
OPALINQ96PE5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPALINQ96PE5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms