Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms