Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SENP8Q96LD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms