Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms