Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms