Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG2Q96I99 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms