Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms