Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF2Q96GP6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms