Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
STAMBPL1Q96FJ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms