Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms