Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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