Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms