Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms