Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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