Protein–RNA interactions for Protein: Q969L4

LSM10, U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM10Q969L4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSM10Q969L4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms