Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms