Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf40Q8WZ69 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms