Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms