Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SELENOMQ8WWX9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms