Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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