Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYRIPQ8NFW9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms