Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC112Q8NEF3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms