Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms