Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms