Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms