Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN19Q8N6F1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms