Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE4Q8N205 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms