Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms