Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms