Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms