Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPGS1Q6ZTW0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms