Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms