Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms