Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC141Q6ZP82 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms