Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB5

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZNB5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms