Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms