Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms