Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms