Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms