Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102BQ68D86 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms