Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms