Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GARNL3Q5VVW2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms