Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms