Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD1Q5SYB0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms