Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms