Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms